- Mục tiêu chung: Sau khi hoàn thành khóa đào tạo, học viên có năng lực cơ bản để thực hiện và phân tích kết quả xét nghiệm sinh học phân tử cơ bản (Real-time PCR); giải trình tự gene Sanger và đánh giá kết quả giải trình tự gene; định danh, phân loại và xác định đột biến gene vi sinh vật.
- Mục tiêu cụ thể:
*Kiến thức
1. Trình bày được các vấn đề chung về chẩn đoán phân tử: Tách chiết acid nucleic, PCR điện di, real-time PCR, giải trình tự gene Sanger.
2. Trình bày được nguyên lý các phương pháp tách chiết acid nucleic, cách chọn lựa phương pháp tách chiết phù hợp cho từng đối tượng
3. Trình bày được nguyên lý phản ứng PCR, real-time PCR, digital PCR, lai phân tử, MLPA, QF-PCR, nhân bản đẳng nhiệt (LAMP, RPA, NASBA) và giải trình tự gene Sanger.
4. Trình bày được phương pháp giải quyết vấn đề phát sinh khi xét nghiệm bằng phương pháp PCR, real-time PCR và giải trình tự gene Sanger.
5. Trình bày được các nguyên tắc về xây dựng và an toàn sinh học trong phòng xét nghiệm sinh học phân tử.
*Kỹ năng
6. Thực hiện được kỹ năng thiết kế mồi (primers) và mẫu dò (probes) cho phản ứng PCR, real-time PCR và giải trình tự gene.
7. Thực hiện được kỹ năng tối ưu hóa phản ứng PCR điện di và real-time PCR.
8. Thực hiện được phương pháp real-time PCR để định lượng virus viêm gan siêu vi B và virus viêm gan siêu vi C (Đường chuẩn, chứng nội / ngoại sinh).
9. Thực hiện được phương pháp real-time PCR để phát hiện TB (Lao) và Streptococcus nhóm B (GBS).
10. Thực hiện được phương pháp multiplex real-time PCR để phát hiện Chlamydia trachomatis và Neisseria gonorrhoaeae (CT-NG); xác định kiểu gene HPV; phát hiện và xác định kiểu gene cagA và vacA của vi khuẩn H. pylori.
11. Phân tích được kiểu gene và đột biến kháng thuốc HBV/HCV; đột biến gene 23S rRNA và gyrA kháng thuốc clarithromycin và levofloxacin của vi khuẩn H. pylori bằng giải trình tự gene Sanger.
12. Xây dựng được cây phân loài HBV/HCV.
13. Phát hiện được đột biến KRAS exon 12 và 13 trong ung thư đại trực tràng bằng phương pháp giải trình tự gene Sanger.
14. Phát hiện được đột biến gene JAK2 V617F trong đa hồng cầu nguyên phát bằng phương pháp allele-specific real-time PCR.
15. Phân tích được đột biến alpha-thallasemia bằng gap PCR và beta-thallasemia bằng giải trình tự Sanger.
16. Sử dụng được các phần mềm tin sinh học như BioEdit, ClustalX, UGENE, Geneious Prime để phân tích trình tự gene.
17. Xác định được các giá trị chẩn đoán của xét nghiệm sinh học phân tử bằng phương pháp định tính và định lượng.
*Thái độ
18. Ý thức được tầm quan trọng của xét nghiệm sinh học phân tử trong thực hành lâm sàng.
19. Ý thức được ứng dụng đa dạng của xét nghiệm sinh học phân tử trong y học.
20. Giải quyết được các vấn đề phát sinh khi thực hiện xét nghiệm sinh học phân tử.
